题意:一段DNA序列s,只包含字符ATGC,长度不超过15,求有多少种长度为n的DNA序列与s的最长公共子序列长度为0~len。
解法:状压dp。
LSC:
if(a[i] == b[j])
dp[i][j] = dp[i - 1][j - 1] + 1;
else
dp[i][j] = max(dp[i - 1][j], dp[i][j - 1]);
dp[i][j]表示分别以第i个元素和第j个元素结尾的待求字符串和已知字符串s的最长公共子序列。
对于本题,用dp[0]~dp[j]可以表示一种待求字符串的状态,可以进一步求出再添加一个字符后的状态。
例如:s为GTC
dp数组为[0, 1, 1],说明最长公共子序列为T,加A后状态不变为011,加G后变为111,加T后不变,加C后变为012。
dp数组为非降序数列,所以可以在上升的位置置1,不变的位置置0,转化为二进制,例如状态011->010,012->011。
记录状态后,列出状态转移方程:
dp[i][j状态分别加四个字符后的状态] += dp[i - 1][j]。
i表示待求字符串长度,j表示状态,因为只与上一长度有关,所以可以用滚动数组优化。
代码:
#include #include #include #include #include #include #include #include #include #include
运行了6s···
可以进行去掉无法达到的状态的优化···
不过写不动了···